Missing coverage evidence...
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ACGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGGTGT  >  minE/2253616‑2253682 |                                                                   aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:66475/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:2172713/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:2181401/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:2223222/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:299733/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:329145/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:407135/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:434956/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:469545/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:492421/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:207130/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:668026/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:848459/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:851074/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:865827/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:890686/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:955232/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:973132/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:975769/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:1450099/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:1060259/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:1178547/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:1195426/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:1223252/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:125594/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:1276122/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:1289647/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:1348382/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:1418942/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:1015132/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:1462896/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:1528889/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:1567172/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:1633805/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:1701491/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:1902062/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtgt  >  1:2038220/1‑67 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtg   <  1:343848/66‑1 (MQ=255) aCGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGgtg   <  1:1801674/66‑1 (MQ=255) |                                                                   ACGCGCGGCAGACCACCGGTGATGTCCTTGGTACCGCCGGATTCCTGCGGAATACGCGCCAGGGTGT  >  minE/2253616‑2253682

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑