Missing coverage evidence...
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GACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGT  >  minE/2269353‑2269419 |                                                                   gACTTCAGGCTCTAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:152902/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGTCATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:1521037/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:1781210/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:943395/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:838988/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:678996/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:505355/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:408343/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:406034/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:302084/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:290600/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:224958/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:2155743/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:2044351/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:2019056/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:1994385/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:1005348/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:1660647/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:1610410/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:1580258/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:1558447/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:1507853/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:1500504/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:1488655/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:1381516/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:1234058/67‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGt  <  1:1103426/67‑1 (MQ=255) |                                                                   GACTTCAGGCTCAAGCCAGACATTAAATTTTTCACCAACTTTCTGTCTTACATGATGCGCCAGCTGT  >  minE/2269353‑2269419

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑