Missing coverage evidence...
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CTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAA  >  minE/2445962‑2446028 |                                                                   cTCACGATGGCGGAATTCAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:1789380/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTc            >  1:662508/1‑57 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:1923339/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:961955/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:658430/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:540809/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:412924/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:26527/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:243445/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:2295580/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:2201399/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:1034943/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:1758784/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:1614020/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:1388509/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:1256458/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:1248724/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:1239726/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:1125175/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGAGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:1118378/1‑67 (MQ=255) cTCACGATGGCGGAATACAACCGCTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGaa  >  1:2012661/1‑67 (MQ=255) |                                                                   CTCACGATGGCGGAATACAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAA  >  minE/2445962‑2446028

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑