Missing coverage evidence...
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GCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAT  >  minE/2503103‑2503168 |                                                                  gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTgcgg                                 >  1:366909/1‑35 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCaa   >  1:1652979/1‑65 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:203351/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:990622/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:88462/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:697276/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:672256/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:587504/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:585843/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:579122/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:571677/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:522183/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:320882/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:2300933/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:2166850/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:2102045/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:1082154/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:2029292/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:1923658/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:1837559/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:1710836/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:1697099/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:1612191/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:1483078/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:1434500/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:1363517/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:1280820/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:127418/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:1266475/1‑66 (MQ=255) gCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAt  >  1:1211869/1‑66 (MQ=255) |                                                                  GCAAGCCGACCCTGGACCTTCCGCTCGAAGTGCGGCGCAAAATGTGGTTCAAACCGTTCATGCAAT  >  minE/2503103‑2503168

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑