Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2540034	2540059	26	24 [0]	[0] 16	rfaJ	UDP‑D‑glucose:(galactosyl)lipopolysaccharide glucosyltransferase

ACTAACAGAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAT  >  minE/2540060‑2540126 |                                                                   aCTAACATAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAt  <  1:30049/67‑1 (MQ=255) aCTAACAGAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAt  <  1:1227463/67‑1 (MQ=255) aCTAACAGAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAt  <  1:12397/67‑1 (MQ=255) aCTAACAGAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAt  <  1:1544538/67‑1 (MQ=255) aCTAACAGAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAt  <  1:1546629/67‑1 (MQ=255) aCTAACAGAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAt  <  1:1598176/67‑1 (MQ=255) aCTAACAGAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAt  <  1:1661452/67‑1 (MQ=255) aCTAACAGAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAt  <  1:2261574/67‑1 (MQ=255) aCTAACAGAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAt  <  1:2285313/67‑1 (MQ=255) aCTAACAGAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAt  <  1:2308050/67‑1 (MQ=255) aCTAACAGAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAt  <  1:274045/67‑1 (MQ=255) aCTAACAGAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAt  <  1:326173/67‑1 (MQ=255) aCTAACAGAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAt  <  1:392980/67‑1 (MQ=255) aCTAACAGAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAt  <  1:430581/67‑1 (MQ=255) aCTAACAGAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAt  <  1:707368/67‑1 (MQ=255) aCTAACAGAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAt  <  1:91584/67‑1 (MQ=255) |                                                                   ACTAACAGAAAAAGCGTTGTCTATTCTTATGAGTAAAGATAATGTTTATAAATACCCTGATCAGGAT  >  minE/2540060‑2540126

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑