Missing coverage evidence...
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CCTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCGG  >  minE/2723220‑2723285 |                                                                  ccTTTTGCCGCGACCGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGt      >  1:1493551/1‑62 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAAcg                          >  1:1363938/1‑42 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:522635/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:2178297/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:290033/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:36345/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:393984/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:405731/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:445077/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:45613/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:472983/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:481228/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:48311/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:2072085/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:596571/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:598567/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:623954/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:742659/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:861134/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:887658/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:889545/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:991025/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:1719641/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:1190507/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:12410/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:1266592/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:1337133/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:1357659/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:1388771/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:1548625/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:1629080/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:164428/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:2123752/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:1789827/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:180293/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:1804247/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:182227/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:1900359/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:2048133/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCgg  >  1:1117800/1‑66 (MQ=255) ccTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCg   >  1:1783188/1‑65 (MQ=255) |                                                                  CCTTTTGCCGCGAACGGGTTTGAAGTGTCGACGGTGGGAACGCGCTGGAAGTTAAGATGGGTGCGG  >  minE/2723220‑2723285

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑