Missing coverage evidence...
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TGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAA  >  minE/2750031‑2750097 |                                                                   tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:620927/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1962819/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:2017769/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:2047153/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:2197022/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:323247/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:338767/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:38650/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:449812/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1959532/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:629653/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:67726/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:683605/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:702852/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:796054/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:801704/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:909368/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:948933/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:195606/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1141907/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1166637/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1202053/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1390362/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1446673/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1506720/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1527847/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1540849/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1632704/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1696233/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1783151/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1801035/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1801958/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1918994/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1048826/67‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGGTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCaaa  <  1:1049738/67‑1 (MQ=255) |                                                                   TGATCGTCAGGGTAACGCGTTGGGTTGGGCAACAGCCGGTGGTTCCGGTTTCCGTGGTTCTCGCAAA  >  minE/2750031‑2750097

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑