Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2862641	2862665	25	16 [0]	[0] 24	hflX	predicted GTPase

CGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCAGCTGCGCCA  >  minE/2862666‑2862725 |                                                            cGCCCAACGTGCGCGTACCCATTAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCa           >  1:1304780/1‑51 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTgg               >  1:1435666/1‑47 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTg                >  1:310383/1‑46 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGgcg             >  1:1245837/1‑49 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGgcg             >  1:314018/1‑49 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGgcg             >  1:2222439/1‑49 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGgcg             >  1:1537589/1‑49 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGgcg             >  1:1548017/1‑49 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCCGCTgc      >  1:1804819/1‑56 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCCGCTg       >  1:314876/1‑55 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCAGCt        >  1:96621/1‑54 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCAGCTgcgc    >  1:1250446/1‑58 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCAGCTgcgc    >  1:788414/1‑58 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCAGCTGCGcc   >  1:174344/1‑59 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCAGCTGCGcc   >  1:1908424/1‑59 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCAGCTGCGCCa  >  1:1683544/1‑60 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCAGCTGCGCCa  >  1:169931/1‑60 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCAGCTGCGCCa  >  1:1025564/1‑60 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCAGCTGCGCCa  >  1:1824492/1‑60 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCAGCTGCGCCa  >  1:2074844/1‑60 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCAGCTGCGCCa  >  1:1363668/1‑60 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCAGCTGCGCCa  >  1:2304904/1‑60 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCAGCTGCGCCa  >  1:260827/1‑60 (MQ=255) cGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCAGCTGCGCCa  >  1:1325263/1‑60 (MQ=255) |                                                            CGCCCAACGTGCGCGTACCCATGAGGGTAAGTTGCAGGTTGAGCTGGCGCAGCTGCGCCA  >  minE/2862666‑2862725

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑