Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2954207	2954272	66	6 [0]	[0] 34	holD	DNA polymerase III, psi subunit

TTAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCA  >  minE/2954273‑2954339 |                                                                   ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:414363/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:1891961/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:2099847/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:2145528/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:21518/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:2225780/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:35678/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:385888/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:389567/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:1851509/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:425060/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:456569/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:515792/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:565840/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:790401/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:961816/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:981363/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:1499342/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:1038537/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:1045017/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:1069319/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:1075827/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:1152159/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:121511/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:1370475/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:1376163/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:1031343/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:1554134/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:1582079/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:1582568/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:1672799/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:1773849/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCa  <  1:1812422/67‑1 (MQ=255) ttAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCAGCAAGGCa  <  1:1689588/67‑1 (MQ=255) |                                                                   TTAACCGTCAGCCCCGACCAGGTGCTGCAACTGACGCCAGAAAAAATCGCGATGCTGCCGCAAGGCA  >  minE/2954273‑2954339

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑