Missing coverage evidence...
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GACATCGCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTCC  >  minE/2963862‑2963928 |                                                                   gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGTGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:1277308/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:7319/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:2173382/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:247793/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:32992/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:509559/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:528474/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:6242/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:649531/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:698985/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:1914049/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:789057/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:832068/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:83559/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:877104/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:935239/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:958556/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:2121485/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:1015818/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:1839052/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:1823642/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:1783554/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:1735766/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:1731923/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:1657880/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:1549620/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:1534886/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:1529255/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:1478415/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:1432081/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:1191912/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:1191886/67‑1 (MQ=255) gacatcgCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTcc  <  1:1028104/67‑1 (MQ=255) |                                                                   GACATCGCGCTGGCAGAAACCCGTGCGGCAATCGCCTACGGTGCTGATGAAGTTGACGTTGTGTTCC  >  minE/2963862‑2963928

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑