Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2972314	2972345	32	22 [0]	[0] 35	radA	predicted repair protein

GAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGCC  >  minE/2972346‑2972412 |                                                                   gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTc                        >  1:1487599/1‑45 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCa                      >  1:59861/1‑47 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAActc               >  1:1016072/1‑54 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAg    >  1:733362/1‑65 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:712019/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:397243/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:451146/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:458108/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:539126/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:544315/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:61721/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:331901/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:745372/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:765757/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:932390/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:960684/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:968610/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:985201/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:325841/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:1241443/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:1375181/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:1488667/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:1724234/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:1813596/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:2097979/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:2155136/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:2158022/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:2205033/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:224961/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:243871/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:244001/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:304901/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:380573/1‑67 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGc   >  1:1810699/1‑66 (MQ=255) gAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGAGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGcc  >  1:66820/1‑67 (MQ=255) |                                                                   GAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGCC  >  minE/2972346‑2972412

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑