Missing coverage evidence...
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ATTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCT  >  minE/209553‑209619 |                                                                   aTTAAGCATGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:2049089/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:549580/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:307314/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:349627/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:385830/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:519809/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:524861/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:530175/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:546735/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:546882/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:285461/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:592418/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:626398/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:663161/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:728161/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:788676/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:824633/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:833848/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:979585/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:1828831/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:1073283/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:1176152/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:1263929/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:1312723/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:1368268/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:1538023/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:1547591/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:1800631/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:1015657/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:2017624/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:2033043/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:205929/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:2227505/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:2256356/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:26508/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:281088/67‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACC‑CCCGGCTTACCGCTGAGTttgct  <  1:508293/66‑1 (MQ=255) |                                                                   ATTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCT  >  minE/209553‑209619

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑