Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA minE 292,996 G→C 100% Q42H (CAG→CAC)  ybaW → conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE292,9960GC100.0% 227.2 / NA 65Q42H (CAG→CAC) ybaWconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base C (0/65);  total (0/65)
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold.
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand.

ATAGCGACAGTTTTCAGTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAC  >  minE/292980‑293047
                |                                                   
aTAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGT‑AATATCAATATTAAc  <  1:1343605/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTTGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:22042/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCGATATTAAc  <  1:1510607/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:399700/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:466818/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:375302/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:349308/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:306174/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:302993/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:258216/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:226684/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:2249481/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:2190822/67‑1 (MQ=255)
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 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:2152984/67‑1 (MQ=255)
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 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:2126866/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:423798/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:2058253/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:467775/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:521555/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:524199/67‑1 (MQ=255)
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 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:702029/67‑1 (MQ=255)
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 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:975575/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1778562/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1157554/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1181087/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1184882/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1186046/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1195535/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1232398/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1262108/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1382500/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1443970/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1455721/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1489904/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:157912/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1723616/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:174909/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:177673/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1906881/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:203940/67‑1 (MQ=255)
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 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1929809/67‑1 (MQ=255)
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 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1895720/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1873292/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1865015/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1857843/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1807147/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:1796767/67‑1 (MQ=255)
 tAGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGGCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:302406/67‑1 (MQ=255)
  aGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:2209985/66‑1 (MQ=255)
  aGCGACAGTTTTCACTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAc  <  1:870746/66‑1 (MQ=255)
                |                                                   
ATAGCGACAGTTTTCAGTGGATGACGGCCCATAACATCGCCTTCGTCGTGGTCAATATCAATATTAAC  >  minE/292980‑293047

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑