Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | minE | 2,855,970 | A→G | 100% | R81R (CGA→CGG) | yjeF → | predicted carbohydrate kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | minE | 2,855,970 | 0 | A | G | 100.0% | 186.5 / NA | 54 | R81R (CGA→CGG) | yjeF | predicted carbohydrate kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (0/54); total (0/54) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
GTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT > minE/2855930‑2855996 | gTCATGTTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1910403/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCTATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1066358/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:6057/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1004061/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:2119783/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:2149416/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:2162752/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:2235704/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:2236454/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:253432/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:287912/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:398911/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:476395/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:52284/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:2092611/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:715032/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:737799/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:819176/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:831280/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:842986/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:87430/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:885215/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:924788/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:951327/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:964891/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:967688/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1574215/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1035302/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1155592/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1191813/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1195059/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1244272/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1273589/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1329175/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1364463/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:146796/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1491187/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1516763/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:159155/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1619035/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1688846/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1701394/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1826789/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1874791/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1910306/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:20073/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:2050365/67‑1 (MQ=255) gTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGGCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:614494/67‑1 (MQ=255) gTCATGGT‑ATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1059117/66‑1 (MQ=255) tCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:503168/66‑1 (MQ=255) tCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:410944/66‑1 (MQ=255) tCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:297889/66‑1 (MQ=255) tCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:1885077/66‑1 (MQ=255) aTGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGATCGGTATTGATGt < 1:2069213/64‑1 (MQ=255) | GTCATGGTAATAACGGCGGCGATGGCTACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGT > minE/2855930‑2855996 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |