| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 317,845 | T→C | 100% | R947R (CGT→CGC) | kefA → | fused mechanosensitive channel proteins |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 317,845 | 0 | T | C | 88.7% | 254.7 / 19.9 | 97 | R947R (CGT→CGC) | kefA | fused mechanosensitive channel proteins |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/9); new base C (0/86); total (2/95) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.18e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.08e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
CGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGGACGGTAAGTAAGATCCG > minE/317797‑317898 | cGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAAcc > 1:1731128/1‑67 (MQ=255) aTTCTGTTCGAGCGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:100012/67‑3 (MQ=25) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTATGgtca < 1:149202/67‑3 (MQ=25) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:2234422/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:381081/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:335055/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:302004/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:299984/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:266045/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:256377/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:244645/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:237646/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:236782/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:383820/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:2188511/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:2182180/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:2121340/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:2098376/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:2053272/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:2017252/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:200621/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:2001783/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:743118/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:993426/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:986311/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:98050/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:970464/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:96694/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:916867/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:881551/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:823833/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:814194/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:744301/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:2023520/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:735310/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:727292/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:705011/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:643262/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:630799/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:628262/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:586955/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:538106/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:53541/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:476700/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1360773/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1466071/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1461875/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1042815/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1458761/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:107323/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1413445/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1391160/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:110144/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1478481/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1107510/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1120794/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1351808/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1327914/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1309518/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1247642/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1227902/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1133646/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1745807/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1935754/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1893153/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:186368/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1852991/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1831346/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1966254/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1784670/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:177529/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1757068/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1607800/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1710798/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1649253/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1634371/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1620916/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1617990/67‑3 (MQ=37) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACCgtca < 1:297991/67‑3 (MQ=25) aTTCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTAAGgtca < 1:1409616/67‑3 (MQ=25) aTTCTGTTCGAACGTCCGGGGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1260569/67‑3 (MQ=255) aTTCTATTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:2024685/67‑3 (MQ=37) ttCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1042160/66‑3 (MQ=37) ttCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:95703/66‑3 (MQ=37) ttCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1036705/66‑3 (MQ=37) ttCTGTTCGAACGTCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:549985/66‑3 (MQ=37) cTATTCGAAGGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAACCATTg < 1:2089659/43‑1 (MQ=255) cTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAACCATTg < 1:1121387/43‑1 (MQ=255) cTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAACCATTg < 1:600532/43‑1 (MQ=255) cTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAACCATTg < 1:591492/43‑1 (MQ=255) cTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAACCATTg < 1:845359/43‑1 (MQ=255) cTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAACCATTg < 1:453094/43‑1 (MQ=255) cTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAACCATTg < 1:1068975/43‑1 (MQ=255) cTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAACCATTg < 1:339254/43‑1 (MQ=255) cTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAACCATTg < 1:2201411/43‑1 (MQ=255) aaCGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGGACGGTAAGTAAGATCCg > 1:1448184/1‑67 (MQ=255) tCCGGTGCGCATAGGCGACACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGTACGgtca < 1:1037586/53‑3 (MQ=25) | CGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAACCATTGGTAGCTTCTCGGGGACGGTAAGTAAGATCCG > minE/317797‑317898 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |