| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 664,995 | T→C | 100% | A151A (GCT→GCC) | ycbY → | predicted methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 664,995 | 0 | T | C | 85.9% | 214.1 / 21.8 | 85 | A151A (GCT→GCC) | ycbY | predicted methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/12); new base C (0/73); total (0/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
AACCGCCAGTATCGCTCTTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGTATTGCGC > minE/664980‑665056 | aaCCGCCAGTATCGCTCTTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCt < 1:339928/67‑1 (MQ=255)aaCCGCCAGTATCGCTCTTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCt < 1:2152555/67‑1 (MQ=255)aaCCGCCAGTATCGCTCTTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCt < 1:1310026/67‑1 (MQ=255)aaCCGCCAGTATCGCTCTTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCt < 1:1092439/67‑1 (MQ=255)aaCCGCCAGTATCGCTCTTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCt < 1:110213/67‑1 (MQ=255)aaCCGCCAGTATCGCTCTTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCt < 1:959251/67‑1 (MQ=255)aaCCGCCAGTATCGCTCTTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCt < 1:1567810/67‑1 (MQ=255)aaCCGCCAGTATCGCTCTTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCt < 1:52823/67‑1 (MQ=255)aaCCGCCAGTATCGCTCTTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCt < 1:1477058/67‑1 (MQ=255)aaCCGCCAGTATCGCTCTTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCt < 1:85270/67‑1 (MQ=255)aaCCGCCAGTATCGCTCTTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCt < 1:780145/67‑1 (MQ=255)aaCCGCCAGTATCGCTCTTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCt < 1:2036856/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATTGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:321280/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:50536/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:409409/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:565986/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:380438/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:579591/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:2315210/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:264779/67‑1 (MQ=255) 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1:723985/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:687305/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:682999/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:637779/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:636908/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:634184/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:633238/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:625659/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:618908/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1343049/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1691752/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1635648/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:16259/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1524200/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1473843/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1460179/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1431877/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1409442/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1378680/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:2112495/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:133822/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1304219/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1284925/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1283042/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1282688/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1280187/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1180609/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1063606/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:2154588/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:2055644/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1966934/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1964404/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:194396/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1923686/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1916317/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:2072074/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1871996/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1866071/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1811981/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:2082179/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:2089029/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGACTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:378738/67‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGAGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:870352/67‑1 (MQ=255) tCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:878544/66‑1 (MQ=255) tCGCCCTTGATCTCAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGCATTgcgc < 1:1747163/66‑1 (MQ=255) tctTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGt > 1:752073/1‑55 (MQ=255) tctTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGt > 1:2303426/1‑55 (MQ=255) tctTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGt > 1:1453398/1‑55 (MQ=255) tctTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGt > 1:2250648/1‑55 (MQ=255) tctTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGt > 1:60775/1‑55 (MQ=255) tctTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGt > 1:1239706/1‑55 (MQ=255) tctTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGt > 1:163211/1‑55 (MQ=255) tctTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGt > 1:413175/1‑55 (MQ=255) tctTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGt > 1:479586/1‑55 (MQ=255) tctTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGt > 1:1142502/1‑55 (MQ=255) tctTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGt > 1:107439/1‑55 (MQ=255) tctTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGt > 1:178177/1‑55 (MQ=255) tctTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGt > 1:1057967/1‑55 (MQ=255) tctTGATCTGAGTGATGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGt > 1:1200023/1‑55 (MQ=255) | AACCGCCAGTATCGCTCTTGATCTGAGTGGTGATGGTTTACATCTGCGTGGCTATCGCGATCGTGCTGGTATTGCGC > minE/664980‑665056 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |