Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2865600	2865697	98	47 [0]	[0] 47	hflC	modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor

GGTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAT  >  minE/2865534‑2865599                                                                  | ggTCATCAACGCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:449331/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:554827/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1070561/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1994954/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:2068457/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:2079485/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:227400/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:254543/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:390535/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:403706/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:427824/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1967042/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:556343/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:579814/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:658051/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:660040/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:734676/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:810492/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:838647/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:854887/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:881755/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:901705/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1525043/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1136941/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:115693/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1173517/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1281978/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1301576/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1364763/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1389743/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1439094/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1510732/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1946974/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1527791/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1626264/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1714278/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1721470/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1749107/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1757978/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1802189/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1897179/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1946360/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGTAAGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1971562/66‑1 (MQ=255) ggTCATCAACCCGAACAGAATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:262005/66‑1 (MQ=255)         aCCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1234508/58‑1 (MQ=255)               aCAGTATGGCGGCGCTGTGTATTGAAGTTGTCTATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:638561/52‑1 (MQ=255)                             cTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAt  <  1:1307404/38‑1 (MQ=255)                                                                  | GGTCATCAACCCGAACAGTATGGCGGCGCTGGGTATTGAAGTTGTCGATGTGCGTATCAAGCAGAT  >  minE/2865534‑2865599

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑