Missing coverage evidence...
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GGCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCC  >  minE/2868690‑2868755                                                                  | ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:2002467/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:923454/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:752610/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:701697/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:698665/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:685282/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:657023/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:53727/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:49667/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:483781/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:46430/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:311713/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:276281/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:272622/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:2061550/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:1137612/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:1334570/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:1142850/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:1163116/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:1183732/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:1259634/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:1264172/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:1266283/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:1334237/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:1895199/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:1366563/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:1370714/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:1728164/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:1771315/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:1776032/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:1784980/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGAGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:2086730/1‑66 (MQ=255) ggCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCCTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGcc  >  1:735892/1‑66 (MQ=255)                                                                  | GGCTCAGCCGCTGGGTGCTGACCGTAAAGGTCGTCGTGAAGCGCGTATTGTCCGCGTACTGGTGCC  >  minE/2868690‑2868755

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑