Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2869544	2869624	81	24 [0]	[0] 2	rnr	exoribonuclease R, RNase R

ATATTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGT  >  minE/2869478‑2869543                                                                  | atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:1856570/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:841314/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:763784/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:640565/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:518136/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:484905/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:381374/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:209669/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:2078921/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:1888764/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:187875/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:1865760/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:108543/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:1644780/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:1593679/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:1478777/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:1446084/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:1416273/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:1367025/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:1310379/66‑1 (MQ=255) atatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:1132533/66‑1 (MQ=255)  tatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:1839116/65‑1 (MQ=255)  tatTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:1187016/65‑1 (MQ=255)                        cTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGt  <  1:1290627/43‑1 (MQ=255)                                                                  | ATATTCTGCAGGGCGATCAGGATCTGCGCGAGCAGTACGCCCCGCTGGTTAAGCATCTCGAAGAGT  >  minE/2869478‑2869543

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑