Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	257589	257636	48	39 [0]	[0] 4	secD	SecYEG protein translocase auxillary subunit

CATCTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAATCGTC  >  minE/257522‑257588                                                                   | catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:44790/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1850285/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1856279/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:2120123/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:2147981/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:21722/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:238805/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:270093/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:309688/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:358379/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1804145/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:497118/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:534535/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:549526/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:616705/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:720848/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:755521/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:860682/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:870305/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1411077/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1036431/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1041787/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1149346/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1181614/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1226608/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1242718/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1383200/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1407818/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1029807/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1517374/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:155953/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1561485/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1568864/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1572524/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1580975/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1697971/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:171930/1‑67 (MQ=255) catcTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCATAAtcgtc  >  1:47639/1‑67 (MQ=255) catcTTCTA‑AAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAAtcgtc  >  1:1457721/1‑66 (MQ=255)                                                                   | CATCTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCGACCAGTGCTCTGATTGCCAACTTGATCTTAATCGTC  >  minE/257522‑257588

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑