Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	295916	295979	64	57 [0]	[0] 33	cof	thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase

CCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAC  >  minE/295850‑295915                                                                  | ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:597938/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:2129936/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:2153659/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:264776/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:357649/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:417185/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:473171/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:503218/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:508013/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:510620/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:510808/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:515058/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:536483/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:579732/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:587097/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:2102287/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:616661/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:666292/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:671967/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:678709/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:695184/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:728491/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:743384/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:820353/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:840747/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:925432/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:933581/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:969207/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:985013/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1679460/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:119633/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1219916/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1250320/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1255548/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1301459/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1364123/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1387442/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1398699/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:141557/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:147962/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1616572/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1651027/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1138821/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1698740/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:170257/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1710106/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:174163/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1833042/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1852931/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1891252/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1908825/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:198854/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1990626/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:206028/1‑66 (MQ=255) ccATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:2091945/1‑66 (MQ=255) caaTTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1238226/3‑66 (MQ=255) acATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAc  >  1:1857399/2‑66 (MQ=255)                                                                  | CCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAC  >  minE/295850‑295915

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑