Missing coverage evidence...
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GCGCTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCAA  >  minE/344886‑344948                                                               | gcgcTGTATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:186270/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:422477/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:2057280/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:2150365/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:241154/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:246201/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:314659/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:370568/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:374745/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:1987707/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:482596/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:654693/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:731403/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:749723/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:895678/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:925489/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:948136/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:1912774/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:1162638/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:127762/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:1293079/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:1347097/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:1503719/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:1547356/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:1633204/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:1648645/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:1681824/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:1727337/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:1864656/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:1894389/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:1102945/63‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGATATGTGCGCGAGCaa  <  1:863537/63‑1 (MQ=255)       gATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:1554318/57‑1 (MQ=255)               taataaACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCaa  <  1:1435407/49‑1 (MQ=255)                                                               | GCGCTGGATGAAAGTAATAAACATAACGTCAATGAGATGATCCATCGTTATGTGCGCGAGCAA  >  minE/344886‑344948

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑