Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	446543	446548	6	36 [0]	[0] 5	kdpD	fused sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with KdpE

GGTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTT  >  minE/446477‑446542                                                                  | ggTGATACCGGCGCATACCGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:1111390/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:206507/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:838772/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:804027/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:649995/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:42242/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:407084/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:381426/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:229362/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:221908/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:2141790/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  >  1:2131612/1‑66 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:2093331/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:1001266/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  >  1:2009632/1‑66 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:1957710/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:1821891/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:1771908/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:1744602/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:1011334/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:1615404/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  >  1:1146206/1‑66 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:1272347/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:1426135/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:128823/66‑1 (MQ=255) ggTGATAACGGCGCACAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  >  1:484341/1‑66 (MQ=255)  gTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:2020426/65‑1 (MQ=255)  gTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:531606/65‑1 (MQ=255)  gTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:334591/65‑1 (MQ=255)  gTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:145990/65‑1 (MQ=255)      tAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCTTCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:1894892/61‑1 (MQ=255)       aaCGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:1650512/60‑1 (MQ=255)              cATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:1550799/53‑1 (MQ=255)                 aaCGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:257006/50‑1 (MQ=255)                    gcggcgGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:386355/47‑1 (MQ=255)                    gcggcgGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCttt  <  1:225677/47‑1 (MQ=255)                                                                  | GGTGATAACGGCGCATAACGCGGCGGCAACCACGCATCCCTGAATTTGTACACGCCACTTGTCTTT  >  minE/446477‑446542

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑