Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	480313	480404	92	40 [0]	[1] 28	cydB	cytochrome d terminal oxidase, subunit II

GAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGT  >  minE/480247‑480312                                                                  | gAAGCTGGCTCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:2119831/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:530473/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:1125114/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:201835/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:204417/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:2049048/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:2068836/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:249203/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:51998/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:527992/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:2011070/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:668885/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:671462/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:703911/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:724081/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:737876/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:801701/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:902478/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:953554/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:1512697/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:119780/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:1200884/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:1265006/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:1295785/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:134375/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:1394087/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:1397271/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:1452642/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:1982809/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:1565376/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:1570152/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:1605582/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:1710182/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:1755365/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:1794370/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:186057/66‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:188200/66‑1 (MQ=255)  aaGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGTCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:593715/65‑1 (MQ=255)  aaGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:1491194/65‑1 (MQ=255)  aaGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt  <  1:339753/65‑1 (MQ=255)                                                                  | GAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGT  >  minE/480247‑480312

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑