Missing coverage evidence...
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TACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCACC  >  minE/523558‑523624                                                                   | tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:468549/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1055218/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1957977/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1960067/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:2010508/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:2117606/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:276009/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:394117/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:435599/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:458505/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:467761/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1863451/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:517893/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:611971/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:681355/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:705847/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:850495/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:889943/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:920298/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:943705/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:95496/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:963575/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:184113/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1127666/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1193258/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1194150/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1199619/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:125609/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1306302/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1370322/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1401223/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1402469/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1517561/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:154561/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1548120/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1627857/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1658400/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1665020/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:174893/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1780982/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1813463/67‑1 (MQ=255) tACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1846239/67‑1 (MQ=255)  aCCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:830576/66‑1 (MQ=255)   ccGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:514930/65‑1 (MQ=255)               aCTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCAcc  <  1:1286685/53‑1 (MQ=255)                                                                   | TACCGATGTGTGTAACTTTCGTTGCACCTACTGCCTGCCGGATGGCTACAAACCGAGCGGCGTCACC  >  minE/523558‑523624

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑