Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	540615	540660	46	18 [0]	[1] 5	rhtA	threonine and homoserine efflux system

GCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGA  >  minE/540548‑540614                                                                   | gCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:1902226/67‑1 (MQ=255) gCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:910289/67‑1 (MQ=255) gCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:833889/67‑1 (MQ=255) gCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:609805/67‑1 (MQ=255) gCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:573816/67‑1 (MQ=255) gCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:418751/67‑1 (MQ=255) gCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:2100120/67‑1 (MQ=255) gCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:1950687/67‑1 (MQ=255) gCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:1147295/67‑1 (MQ=255) gCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:1789017/67‑1 (MQ=255) gCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:1633324/67‑1 (MQ=255) gCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:1601852/67‑1 (MQ=255) gCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:1564844/67‑1 (MQ=255) gCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:1525624/67‑1 (MQ=255) gCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:1332984/67‑1 (MQ=255) gCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:1320664/67‑1 (MQ=255) gCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:125774/67‑1 (MQ=255)                                cGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGa  <  1:1943839/36‑1 (MQ=255)                                                                   | GCCCCCAGTGCCAGCGCACAGCCGGTTAAATCGACATGGGAAACGTCTTGCCCCAGCGGTAGCAGGA  >  minE/540548‑540614

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑