Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	543966	543976	11	26 [0]	[0] 20	yliL/mntR	hypothetical protein/transcriptional regulator of mntH

CATAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATTA  >  minE/543912‑543965                                                      | catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:1113673/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:975024/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:864987/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:773154/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:613258/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:584342/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:273280/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:2122898/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:2008022/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:1978383/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:186514/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:1844148/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:1626476/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:1471303/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:1286752/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:1276019/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:1162679/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:1150567/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:1146024/54‑1 (MQ=255) catAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:1098331/54‑1 (MQ=255)  atAAGACCTCCTGACTTGCTTATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:914222/53‑1 (MQ=255)  atAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  <  1:900770/53‑1 (MQ=255)       aCCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  >  1:1862812/1‑48 (MQ=255)       aCCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  >  1:1419482/1‑48 (MQ=255)       aCCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  >  1:1398419/1‑48 (MQ=255)       aCCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATta  >  1:1287620/1‑48 (MQ=255)                                                      | CATAAGACCTCCTGACTTGCTAATCCCGTCGATCCTTGAGGGATGATTGCATTA  >  minE/543912‑543965

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑