Missing coverage evidence...
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GCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAG  >  minE/22207‑22273                                                                   | gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:552351/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:1077297/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:2008914/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:2052021/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:2143012/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:240407/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:279603/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:463845/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:503788/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:1998142/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:572581/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:651131/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:665681/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:796117/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:81907/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:831056/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:93648/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:97432/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:1505152/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:1088141/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:1114171/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:1291672/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:1294100/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:13266/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:134224/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:1353186/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:1433387/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:1960622/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:1523772/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:1525598/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:156684/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:180814/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:184168/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:1851482/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:1953605/1‑67 (MQ=255) gCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGAAATCATCAAAGACCGTCAg  >  1:428506/1‑67 (MQ=255)                                                                   | GCGTCTGATGCGCTTCTGCTCCGTTGAGATGGGTTCCTTCTACCTCGACATCATCAAAGACCGTCAG  >  minE/22207‑22273

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑