Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	769486	769504	19	59 [1]	[0] 8	phoP	DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with PhoQ

CACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCAG  >  minE/769420‑769486                                                                  |  cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGTGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:2067692/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:42396/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:2003930/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:2019797/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:2028574/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:2070896/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:2074546/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:2109385/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:220368/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:244541/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:255061/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:364591/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:394172/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:401576/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:422348/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1857989/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:448476/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:523772/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:567996/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:581191/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:646203/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:673011/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:791426/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:856079/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:866734/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:877676/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:888478/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:970155/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:98693/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1403370/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1157752/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:116047/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1201640/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1219907/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1236133/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1261683/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1262649/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:126298/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1267449/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:12695/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1292747/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1372274/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1400265/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:101617/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1408845/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1411595/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1412640/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1442472/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1449235/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:145733/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:149522/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1502997/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1546345/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:160818/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1722434/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1834759/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1838694/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCa   >  1:1847268/1‑66 (MQ=255) cACCGGCACTTAATA‑TTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCAg  >  1:723696/1‑66 (MQ=255)                                                                  |  CACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCTGCCAGCTTTCACGGGCGGTTAATACCAGAATCGGCAG  >  minE/769420‑769486

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑