Missing coverage evidence...
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ACCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGA  >  minE/38776‑38840                                                                 | aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:627795/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:1989147/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:2024476/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:2042132/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:2151986/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:240523/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:252608/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:382326/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:394025/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:1051366/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:682289/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:693104/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:747722/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:799845/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:914275/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:990410/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:990880/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:1808434/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:1747804/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:1637678/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:158383/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:1071301/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:1402495/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:1359539/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:1338568/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:1336028/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:1277731/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:1217351/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:1206350/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:1085924/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:1178210/65‑1 (MQ=255) aCCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:1165766/65‑1 (MQ=255)  ccGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:101898/64‑1 (MQ=255)  ccGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:1985818/64‑1 (MQ=255)       gACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGa  <  1:701491/59‑1 (MQ=255)                            cATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGGACGTCACTGGCGa  <  1:155895/38‑1 (MQ=255)                                                                 | ACCGCTGACAATGAACACCCAACCCAGCATCAGGAAGCTCAGGTAACTACGCACGTCACTGGCGA  >  minE/38776‑38840

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑