Missing coverage evidence...
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CTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAA  >  minE/866111‑866177                                                                   | cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:267292/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:945076/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:901388/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:875366/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:768760/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:630140/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:582304/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:55911/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:532172/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:527464/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:461411/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:375212/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:238361/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:2038024/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:1120767/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:116491/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:1168090/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:1273210/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:1295736/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:1369589/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:1464177/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:1661171/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:182870/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:1911087/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:2082202/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGCTGaa  <  1:1110386/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTGCACCACCGATGGTGaa  <  1:458611/67‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGGCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:516052/67‑1 (MQ=255)  tGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGGCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:1049363/66‑1 (MQ=255)                            tAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGaa  <  1:812637/40‑1 (MQ=255)                                                                   | CTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAA  >  minE/866111‑866177

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑