Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 880309 880323 15 56 [0] [0] 46 yciM conserved hypothetical protein

ACAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGC  >  minE/880242‑880308
                                                                  |
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:415368/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1851908/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1872381/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1876134/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1927449/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:193460/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:2005264/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:2049377/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:2109970/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:227507/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:260428/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:263509/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:29780/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:400845/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1825487/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:443504/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:525917/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:557254/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:589727/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:599115/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:686002/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:712336/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:737634/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:898915/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:965300/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:966702/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:971513/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1413406/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1112975/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1176424/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1237188/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:125447/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1271827/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1347504/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:135491/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1359723/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1379918/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1395036/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1404045/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:179637/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1444324/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1458774/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1502342/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1525987/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1623854/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:163420/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1672062/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1729993/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1731589/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1742138/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:174523/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1787633/67‑1 (MQ=255)
aCAGAGAACTGGTCAGCGAAAAGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:531178/67‑1 (MQ=255)
 cAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1218831/66‑1 (MQ=255)
 cAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:1113093/66‑1 (MQ=255)
             cAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGc  <  1:107380/54‑1 (MQ=255)
                                                                  |
ACAGAGAACTGGTCAGCGAAACGCTGGAAATGTTGCAAACCTGCTATCAGCAGTTGGGTAAAACTGC  >  minE/880242‑880308

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: