Missing coverage evidence...
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TACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAT  >  minE/944344‑944410                                                                   | tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:259772/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:982309/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:928943/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:927663/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:921467/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:860040/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:851761/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:843561/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:73456/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:523719/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:424677/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:393897/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:263957/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:1064032/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:255222/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:2083867/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:2027826/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:1988301/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:1929344/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:1895559/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:175525/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:1716710/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:1660388/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:1640115/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:1508618/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:1401682/67‑1 (MQ=255) tACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:1180883/67‑1 (MQ=255)  aCCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:308807/66‑1 (MQ=255)  aCCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:556262/66‑1 (MQ=255)  aCCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAt  <  1:1586097/66‑1 (MQ=255)                                                                   | TACCGATATCCAGCGATGCCTGCACGATCAGCGGCGGTAGGGAGTTACGTAAAATATGCCAGTTGAT  >  minE/944344‑944410

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑