Missing coverage evidence...
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TTAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCACC  >  minE/990540‑990605                                                                  | ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:350470/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:963785/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:818312/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:788719/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:668769/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:631203/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:602917/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:583741/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:563602/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:503188/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:460507/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:1136289/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:316336/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:290643/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:2098667/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:2010486/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:1808086/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:1685122/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:14965/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:1355649/66‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGGCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:181146/66‑1 (MQ=255)  tAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:1344853/65‑1 (MQ=255)  tAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCAcc  <  1:1196740/65‑1 (MQ=255)                        cGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCACTCAcc  <  1:668953/43‑1 (MQ=255)                                                                  | TTAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTCTGACCTCTCACC  >  minE/990540‑990605

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑