Missing coverage evidence...
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GCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAG  >  minE/992140‑992194                                                       | gCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTGAGGATGTTAg  <  1:20130/55‑1 (MQ=255) gCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAg  <  1:2032108/55‑1 (MQ=255) gCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAg  <  1:763449/55‑1 (MQ=255) gCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAg  <  1:751651/55‑1 (MQ=255) gCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAg  <  1:678713/55‑1 (MQ=255) gCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAg  <  1:423388/55‑1 (MQ=255) gCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAg  <  1:289241/55‑1 (MQ=255) gCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAg  <  1:2128203/55‑1 (MQ=255) gCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAg  <  1:1953898/55‑1 (MQ=255) gCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAg  <  1:1696428/55‑1 (MQ=255) gCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAg  <  1:1512804/55‑1 (MQ=255) gCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAg  <  1:1313044/55‑1 (MQ=255) gCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAg  <  1:1225646/55‑1 (MQ=255) gCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAg  <  1:1106/55‑1 (MQ=255) gCTATTGCAGGTAAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAg  <  1:2098421/55‑1 (MQ=255)  cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAg  <  1:1101117/54‑1 (MQ=255)  cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAg  <  1:245578/54‑1 (MQ=255)  cTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAg  <  1:144608/54‑1 (MQ=255)                                                       | GCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAG  >  minE/992140‑992194

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑