Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1016303	1016386	84	16 [0]	[1] 14	manA	mannose‑6‑phosphate isomerase

ATTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGCC  >  minE/1016236‑1016302                                                                   | aTTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGcc  >  1:101306/1‑67 (MQ=255) aTTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGcc  >  1:1040125/1‑67 (MQ=255) aTTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGcc  >  1:1040455/1‑67 (MQ=255) aTTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGcc  >  1:1485408/1‑67 (MQ=255) aTTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGcc  >  1:1698379/1‑67 (MQ=255) aTTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGcc  >  1:1754452/1‑67 (MQ=255) aTTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGcc  >  1:1826242/1‑67 (MQ=255) aTTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGcc  >  1:19987/1‑67 (MQ=255) aTTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGcc  >  1:214771/1‑67 (MQ=255) aTTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGcc  >  1:31635/1‑67 (MQ=255) aTTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGcc  >  1:333168/1‑67 (MQ=255) aTTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGcc  >  1:420102/1‑67 (MQ=255) aTTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGcc  >  1:422588/1‑67 (MQ=255) aTTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGcc  >  1:42384/1‑67 (MQ=255) aTTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGcc  >  1:653387/1‑67 (MQ=255) aTTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGcc  >  1:83281/1‑67 (MQ=255)                                                                   | ATTAATTTCCACATTAAAACAGGGATTGATCATGCAAAAACTCATTAACTCAGTGCAAAACTATGCC  >  minE/1016236‑1016302

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑