Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1046491	1046533	43	21 [0]	[0] 5	ydhH	conserved hypothetical protein

TCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTC  >  minE/1046424‑1046490                                                                   | tCGTTCGCAGCCCCCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:1665805/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:1733607/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:849528/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:839690/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:733075/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:66883/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:538077/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:25596/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:229332/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:2053773/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:1974379/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:1777248/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:1215716/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:1718825/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:171503/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:1651025/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:1501933/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:1487215/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:1478756/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:1388723/1‑67 (MQ=255) tCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTc  >  1:1251426/1‑67 (MQ=255)                                                                   | TCGTTCGCAGCCACCGCTCAACAAAACTTGTTCAGAAATGGTCACGGCGGTGAGTTCTGCCAGTGTC  >  minE/1046424‑1046490

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑