Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1117555	1117570	16	46 [0]	[0] 13	ydiU	conserved hypothetical protein

CCAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAT  >  minE/1117488‑1117554                                                                   | ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:379239/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1061315/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:2014408/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:2017522/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:2022897/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:202364/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:2065976/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:2088838/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:2140573/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:235217/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:257390/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:258897/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1968694/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:394356/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:429282/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:545629/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:550241/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:575857/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:576987/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:578549/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:722598/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:79235/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:906173/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1539274/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1167068/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1263879/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1363981/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1366884/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1384341/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1438342/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1480679/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1507233/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1515413/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1535610/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1876234/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1541737/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1560425/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:166105/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1714830/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1733093/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1784802/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1808452/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1812597/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1868849/1‑67 (MQ=255) ccAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACCGACAt  >  1:695338/1‑67 (MQ=255) acAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAt  >  1:1807694/2‑67 (MQ=255)                                                                   | CCAAGTAGCCTTTAACTCGAGCAGCTGACTTCCAGCCGTTTACCCCAGTCAGGTGGACGACTGACAT  >  minE/1117488‑1117554

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑