Missing coverage evidence...
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GGGGAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGAA  >  minE/1206169‑1206227                                                           | ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGATCATTATGaa  <  1:343731/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:291637/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:847954/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:62102/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:520542/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:486525/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:445812/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:412777/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:363920/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:356186/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:938148/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:233412/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:224427/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:1110475/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:1666972/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:1596124/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:1573324/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:1414826/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:1377537/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:1308215/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:1143938/59‑1 (MQ=255) ggggAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGGCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:952584/59‑1 (MQ=255)            ccGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:2011878/48‑1 (MQ=255)                tCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGaa  <  1:301046/44‑1 (MQ=255)                                                           | GGGGAGGCAGCCCGTTCAATGCTGCCAGCCGCATTGTCGTCGACAAAGAGCATTATGAA  >  minE/1206169‑1206227

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑