Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1208345	1208345	1	9 [0]	[0] 30	manZ	mannose‑specific enzyme IID component of PTS

GGTGCGTCTGGCAACCCGTTACTACGGCGTAGCGTATGGTTACTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAA  >  minE/1208278‑1208344                                                                   | ggTGCGTCTGGCAACCCGTTACTACGGCGTAGCGTATGGTTACTCCAAAGGTATCGATATCGTTaaa  <  1:1333109/67‑1 (MQ=255) ggTGCGTCTGGCAACCCGTTACTACGGCGTAGCGTATGGTTACTCCAAAGGTATCGATATCGTTaaa  <  1:1423081/67‑1 (MQ=255) ggTGCGTCTGGCAACCCGTTACTACGGCGTAGCGTATGGTTACTCCAAAGGTATCGATATCGTTaaa  <  1:1644654/67‑1 (MQ=255) ggTGCGTCTGGCAACCCGTTACTACGGCGTAGCGTATGGTTACTCCAAAGGTATCGATATCGTTaaa  <  1:2052506/67‑1 (MQ=255) ggTGCGTCTGGCAACCCGTTACTACGGCGTAGCGTATGGTTACTCCAAAGGTATCGATATCGTTaaa  <  1:373346/67‑1 (MQ=255) ggTGCGTCTGGCAACCCGTTACTACGGCGTAGCGTATGGTTACTCCAAAGGTATCGATATCGTTaaa  <  1:571266/67‑1 (MQ=255) ggTGCGTCTGGCAACCCGTTACTACGGCGTAGCGTATGGTTACTCCAAAGGTATCGATATCGTTaaa  <  1:831163/67‑1 (MQ=255) ggTGCGTCTGGCAACCCGTTACTACGGCGTAGCGTATGGTTACTCCAAAGGTATCGATATCGTTaaa  <  1:873121/67‑1 (MQ=255) ggTGCGTCTGGCAACCCGTTACTACGGAGTAGCGTATGGTTACTCCAAAGGTATCGATATCGTTaaa  <  1:1762852/67‑1 (MQ=255)                                                                   | GGTGCGTCTGGCAACCCGTTACTACGGCGTAGCGTATGGTTACTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAA  >  minE/1208278‑1208344

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑