Missing coverage evidence...
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CCCAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTT  >  minE/1240071‑1240136                                                                  | cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:1705338/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:900650/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:771041/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:663110/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:658023/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:601308/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:574679/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:414204/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:222387/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:1903866/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:1834292/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:1019090/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:1531387/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:1481206/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:1321701/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:1228721/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:1164645/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:1109250/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:1098332/66‑1 (MQ=255) cccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:1036638/66‑1 (MQ=255)  ccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:1686656/65‑1 (MQ=255)  ccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:675434/65‑1 (MQ=255)  ccAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGtt  <  1:1028791/65‑1 (MQ=255)                                                                  | CCCAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTT  >  minE/1240071‑1240136

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑