Missing coverage evidence...
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CCAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACGAGA  >  minE/1300785‑1300850                                                                  | ccATCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:1490676/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCTGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:556981/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGTCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:483680/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:232569/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:2133126/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:250434/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:262469/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:378824/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:385114/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:525017/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:527520/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:558837/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:573197/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:643514/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:676563/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:693194/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:698868/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:863839/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:92104/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:955464/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:1407976/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:107714/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:1132045/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:115160/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:1195915/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:131557/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:1323780/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:1381047/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:1054693/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:1530097/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:192395/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:1953404/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:2053817/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:2082677/66‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:2127117/66‑1 (MQ=255)  cAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:1707464/65‑1 (MQ=255)  cAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:1377766/65‑1 (MQ=255)  cAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:1889840/65‑1 (MQ=255)  cAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:1276395/65‑1 (MQ=255)                        aaCATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACgaga  <  1:551654/43‑1 (MQ=255)                                                                  | CCAGCGCCAGCCAACCGCAAAGGAACATGGCCGCCGCGCACCAGACTAACATCAGCGGTAACGAGA  >  minE/1300785‑1300850

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑