Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	103923	103937	15	46 [0]	[0] 22	ampD	N‑acetyl‑anhydromuranmyl‑L‑alanine amidase

CAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAC  >  minE/103857‑103922                                                                  | cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGTGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:990472/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:442258/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1119765/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1921181/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:2109186/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:2154107/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:229108/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:23320/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:284122/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:284914/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:302861/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:38753/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:401934/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1890335/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:691156/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:702638/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:735685/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:790186/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:829470/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:863729/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:920890/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:924936/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:999572/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1325804/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1154499/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1189197/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1195458/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1201998/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1215936/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1235588/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1242431/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:127985/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1282807/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1829036/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1582546/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1604625/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1616735/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1634766/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1697605/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1723291/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1739082/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1818003/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1820718/66‑1 (MQ=255) cAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGAGTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1205839/66‑1 (MQ=255)  aGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:1717560/65‑1 (MQ=255)                            cgGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAc  <  1:787776/39‑1 (MQ=255)                                                                  | CAGTATCAACAGCTTGCGGCGGTTACGCGGGCACTGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAAC  >  minE/103857‑103922

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑