Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1429867	1429874	8	28 [0]	[0] 13	napA	nitrate reductase, periplasmic, large subunit

AACGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAC  >  minE/1429801‑1429866                                                                  | aaCGGAATCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:1705640/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:1612956/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:983009/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:868424/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:768100/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:637769/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:537297/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:501176/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:436244/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:396019/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:361500/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:303858/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:1993855/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:1793331/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:103507/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:1454474/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:135724/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:1289651/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:1252829/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:1217987/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:1217492/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:1201751/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:1158410/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:1134805/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:1085539/66‑1 (MQ=255) aaCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:1082905/66‑1 (MQ=255)  aCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGTCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:1126234/65‑1 (MQ=255)  aCGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAc  <  1:1384306/65‑1 (MQ=255)                                                                  | AACGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAAC  >  minE/1429801‑1429866

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑