Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1442778	1442943	166	25 [0]	[1] 2	rcsD	phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

AAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAAT  >  minE/1442711‑1442777                                                                   | aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:1906352/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:992618/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:848657/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:785060/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:696963/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:630311/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:586337/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:525505/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:518154/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:2153962/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:2050736/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:199480/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:1949374/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:105337/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:1749920/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:173548/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:1670967/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:1647055/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:1634455/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:1529059/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:147895/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:1249075/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:1157456/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:1134875/1‑67 (MQ=255) aaaGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAat  >  1:1116707/1‑67 (MQ=255)                                                                   | AAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACGTATTTTGCTGCTACTGATGCAAT  >  minE/1442711‑1442777

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑