Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1520225	1520258	34	4 [0]	[0] 72	truA	pseudouridylate synthase I

CCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCCGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGC  >  minE/1520157‑1520224                                                                    | cccTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCC‑CCAGCTTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGc  <  1:1883359/67‑1 (MQ=255) cccTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCC‑CCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGc  <  1:1110294/67‑1 (MQ=255) cccTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCC‑CCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGc  <  1:756035/67‑1 (MQ=255)  ccTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCC‑CCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGc  <  1:367982/66‑1 (MQ=255)                                                                    | CCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCCGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGC  >  minE/1520157‑1520224

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑