Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1523804	1523845	42	27 [0]	[0] 3	flk	predicted flagella assembly protein

GCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGAA  >  minE/1523761‑1523803                                           | gaaaaCAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:658081/41‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:1877499/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:847351/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:639235/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:629905/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:482098/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:459120/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:389946/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:363901/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:2066692/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:2057960/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:101430/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:1652286/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:1490158/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:145404/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:1453827/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:1394987/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:1279664/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:1249876/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:122092/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:1208219/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:108996/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:1085314/43‑1 (MQ=255) gCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:1058520/43‑1 (MQ=255)  cAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:1956643/42‑1 (MQ=255)  cAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:490578/42‑1 (MQ=255)       aGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGaa  <  1:335688/37‑1 (MQ=255)                                           | GCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGAA  >  minE/1523761‑1523803

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑