Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1524157	1524160	4	14 [0]	[0] 32	flk	predicted flagella assembly protein

GCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGT  >  minE/1524119‑1524156                                      | gCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGt  <  1:1044170/38‑1 (MQ=255) gCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGt  <  1:1259472/38‑1 (MQ=255) gCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGt  <  1:1432502/38‑1 (MQ=255) gCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGt  <  1:1485485/38‑1 (MQ=255) gCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGt  <  1:165525/38‑1 (MQ=255) gCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGt  <  1:1778029/38‑1 (MQ=255) gCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGt  <  1:2063767/38‑1 (MQ=255) gCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGt  <  1:262147/38‑1 (MQ=255) gCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGt  <  1:305498/38‑1 (MQ=255) gCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGt  <  1:36391/38‑1 (MQ=255) gCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGt  <  1:571959/38‑1 (MQ=255) gCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGt  <  1:646166/38‑1 (MQ=255) gCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGt  <  1:847705/38‑1 (MQ=255) gCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGt  <  1:874747/38‑1 (MQ=255)                                      | GCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGT  >  minE/1524119‑1524156

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑