Missing coverage evidence...
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AGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCC  >  minE/1524693‑1524758                                                                  | aGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACCACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTccc  >  1:1978908/1‑66 (MQ=255) aGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTccc  >  1:1937327/1‑66 (MQ=255) aGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTccc  >  1:901948/1‑66 (MQ=255) aGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTccc  >  1:622722/1‑66 (MQ=255) aGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTccc  >  1:469400/1‑66 (MQ=255) aGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTccc  >  1:455186/1‑66 (MQ=255) aGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTccc  >  1:392089/1‑66 (MQ=255) aGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTccc  >  1:379844/1‑66 (MQ=255) aGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTccc  >  1:282526/1‑66 (MQ=255) aGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTccc  >  1:105664/1‑66 (MQ=255) aGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTccc  >  1:1749949/1‑66 (MQ=255) aGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTccc  >  1:1620467/1‑66 (MQ=255) aGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTccc  >  1:1517230/1‑66 (MQ=255) aGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTccc  >  1:149964/1‑66 (MQ=255) aGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTccc  >  1:1369672/1‑66 (MQ=255) aGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTccc  >  1:1128035/1‑66 (MQ=255) aGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTccc  >  1:1096425/1‑66 (MQ=255)                                                                  | AGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCC  >  minE/1524693‑1524758

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑