Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1532594	1532665	72	38 [0]	[1] 65	aroC	chorismate synthase

TTTTGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAG  >  minE/1532527‑1532593                                                                   | ttttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:1045441/67‑1 (MQ=255) ttttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:995387/67‑1 (MQ=255) ttttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:945324/67‑1 (MQ=255) ttttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:862656/67‑1 (MQ=255) ttttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:834354/67‑1 (MQ=255) ttttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:467187/67‑1 (MQ=255) ttttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:370235/67‑1 (MQ=255) ttttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:2139657/67‑1 (MQ=255) ttttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:1726332/67‑1 (MQ=255) ttttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:1446271/67‑1 (MQ=255) ttttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:100441/67‑1 (MQ=255) ttttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:1099775/67‑1 (MQ=255) ttttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:1231214/67‑1 (MQ=255) ttttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:1221287/67‑1 (MQ=255) ttttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:1165201/67‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:408131/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:961126/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:1067373/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:847642/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:1105503/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:660183/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:659144/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:640428/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:517171/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:480771/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:1119052/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:413342/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:1338060/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:349071/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:1836598/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:1825732/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:175718/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:1736415/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:1565599/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:154753/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:1296345/66‑1 (MQ=255)  tttGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGGCGAg  <  1:1557130/66‑1 (MQ=255)                      ggcgCTGGGCGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAg  <  1:1699825/46‑1 (MQ=255)                                                                   | TTTTGACCTGATCCGGCTCGCGGCGCTGGGTGGTATAGCGCGATGTCCCAGGGCGACGACGGTCGAG  >  minE/1532527‑1532593

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑